טכנולוגיית מיקוד אוטומטי מסוג Dual Pixel CMOS של Canon ידועה בתעשייה כמערכת שעליה יוצרי סרטים וצלמים מקצועיים יכולים לסמוך. מצלמת EOS R5 C יורשת גרסה משופרת של מערכת זו הכוללת מיקוד אוטומטי של העין ו-EOS iTR AF X. טכנולוגיה זו משתמשת באלגוריתם למידה עמוקה מתקדם המזהה פנים בצורה מדויקת, גם כאשר ניתן לראות רק עין אחת, והיא עוקבת אחר הנושא גם כשהוא מסיט את מבטו מהמצלמה.
מצלמת EOS R5 C כוללת את אותן הגדרות מיקוד אוטומטי בלעדיות שקיימות במצלמות Cinema EOS, כגון זיהוי Face Only ו-Face Priority, כדי לוודא שהמצלמה מגיבה לשינויים בסצנה כמתוכנן. ניתן גם לבצע התאמות עדינות במהירות המיקוד האוטומטי ובתגובה כדי להשיג משיכות מיקוד קולנועיות איטיות או מיקוד אוטומטי מיידי לפעילויות מהירות.
ניתן להשתמש במערכת מיקוד אוטומטי מסוג Dual Pixel CMOS של Canon גם כשהצלם משתמש במיקוד ידני. מדריך המיקוד הוא כלי מדויק וחדשני שמציג לצלם אם מיקוד הנושא נמצא מלפנים או מאחור. כאשר העזר החזותי של מדריך המיקוד במסך ה-LCD או העינית הופך לירוק, הושג מיקוד ידני חד.